Secuencian el genoma del alga roja de Irlanda
Un internacional de científicos ha secuenciado el genoma del alga roja o musgo de Irlanda (Chondrus crispus).
"Ahora conocemos más cosas de su funcionamiento, sus biomoléculas y la
evolución de las plantas y las algas", explican los expertos del Centro
de de Regulación Genómica que colaboran en la investigación. Los
resultados se publican esta en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences.
Paseando por la zona rocosa intermareal de la costa
podemos ver un paisaje fascinante a menudo dominado por algas de
diferentes tipos. Es un ambiente lleno de fantásticos descubrimientos
como las enigmáticas algas marinas. Aunque no tengan flores, no falta
color entre las algas. El color verde, más común en el césped y las
hierbas, aquí es sustituido por el rojo y el marrón. Son las algas rojas
las que causan este efecto.
En la evolución, estas algas son un grupo hermano de
todas las plantas verdes y algas con quien comparten un ancestro común
hace 1.500 millones de años. "En comparación con las plantas verdes,
sabemos muy poco de las algas rojas. Para conocer algo más de estas
misteriosas plantas, un consorcio internacional ha analizado el genoma
de Chondrus crispus,
o musgo de Irlanda", aseguran los investigadores del Centro de de
Regulación Genómica (CRG) que participan el proyecto que ha secuenciado
el genoma de esta alga.
“Lo que hemos descubierto al analizar el genoma es
que las algas rojas son muy diferentes a sus parientes verdes: tienen
menos genes que la mayoría de sus relativos verdes, los genes son más
compactos y hay muchos genes que no se encuentran en ambos grupos”,
explica Jonas Collén, investigador principal del proyecto en la Estación
Biológica de Roscoff (Francia). La secuenciación del genoma ha ayudado
también a conocer la evolución de las plantas.
El consorcio internacional de esta investigación está
liderado por la Estación Biológica de Roscoff en Brittany,
que pertenece al Centre national de la recherche scientifique (CNRS) y a la Université Pierre et Marie Curie
(UPMC). El genoma se secuenció y anotó en el Centro Nacional de
Secuenciación de Francia, Genoscope. En España, investigadores del Centro de Regulación Genómica (CRG) han contribuido en el comparativo de este nuevo genoma secuenciado comparándolo con otros genomas de plantas y algas existentes.
Peculiaridades de este ser vivo acuático
Chondrus
crispus es una alga roja de cerca de 20 cm que a menudo se encuentra en
la costa rocosa del Atlántico norte pero también a lo largo de toda la
Europea y al sur de España. Esta especie se utiliza para cocinar un
postre típico que se elabora hirviendo el musgo de Irlanda con leche y
azúcar.
El compuesto que espesa la leche, el carragaén, se
utiliza a menudo en la industria alimentaria (E407) en productos como
los helados o el pudín. En general, las algas rojas se utilizan para la
alimentación y como espesante, y representan un de negocio de cerca de 2.000 millones de dólares americanos al año.
“Una de las cuestiones más importantes que hemos
abordado con este proyecto ha sido identificar qué genes de las algas
rojas se pueden encontrar también en otras especies. Existen linajes
completos de organismos protozoarios que establecieron relaciones de
simbiosis con los ancestros de Chondrus y se cree que ello les permitió adquirir nuevos genes”, añade Toni Gabaldón, jefe del grupo Genómica Comparativa en el CRG.
Los resultados de la investigación sugieren que las
algas rojas pasaron por un cuello de botella durante su evolución,
perdiendo muchos de sus genes y reduciendo su tamaño. "Las plantas
terrestres de hoy y los árboles son verdes, sin este cuello de botella,
quién sabe si hoy nuestros árboles y plantas serían rojos...", señalan
los científicos.
El genoma también ayuda a comprender la relación
entre las algas rojas y el resto de organismos, cómo viven en su
ambiente y cómo producen sus biomoléculas, por ejemplo, el carragaén.
También acelera los esfuerzos para comprender la biología de estos
organismos.
El consorcio de Chondrus
incluye laboratorios de Francia, Alemania, el Reino Unido, la República
Checa, España, Egipto, Noruega y Grecia. Genoscope ha aportado la
mayoría de la financiación, apoyo informático y de secuenciación.
Referencia bibliográfica:
Jonas Collén, Betina Porcel, Wilfrid Carré, Steven G.
Ball, Cristian Chaparro, Thierry Tonon, Tristan Barbeyron, Gurvan
Michel, Benjamin Noel, Klaus Valentin, Marek Elias, François
Artiguenave, Alok Arun, Jean-Marc Aury, José F. Barbosa-Neto, John H.
Bothwell, François-Yves Bouget, Loraine Brillet, Francisco
Cabello-Hurtado, Salvador Capella-Gutiérrez, Bénédicte Charrier, Lionel
Cladière, J. Mark Cock, Susana M. Coelho, Christophe Colleoni, Mirjam
Czjzek, Corinne Da Silva, Ludovic Delage, France Denoeud, Philippe
Deschamps, Simon M. Dittami, Toni Gabaldón, Claire M. M. Gachon, Agnès
Groisillier, Cécile Hervé, Kamel Jabbari, Michael Katinka, Bernard
Kloareg, Nathalie Kowalczyk, Karine Labadie, Catherine Leblanc, Pascal
J. Lopez, Deirdre H. McLachlan, Laurence Meslet-Cladiere, Ahmed
Moustafa, Zofia Nehr, Pi Nyvall Collén, Olivier Panaud, Frédéric
Partensky, Julie Poulain, Stefan A. Rensing, Sylvie Rousvoal, Gaelle
Samson, Aikaterini Symeonidi, Jean Weissenbach, Antonios Zambounis,
Patrick Wincker and Catherine Boyen, "Genome structure and metabolic
features in the red seaweed Chondrus crispus shed light on evolution of the Archaeplastida". Proceedings of the Natural Academy of Sciences (PNAS). Publicado online la semana del 11 de marzo de 2013
Fuente: Centro de de Regulación Genómica
14/03/13
SINC
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